Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms