Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PADI1Q9ULC6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms