Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms