Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RDH8Q9NYR8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RDH8Q9NYR8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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RDH8Q9NYR8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RDH8Q9NYR8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RDH8Q9NYR8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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