Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPOQ9BU64 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPOQ9BU64 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms