Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPA33Q99795 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms