Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms