Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELP4Q96EB1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms