Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC103Q8IW40 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms