Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HACD2Q6Y1H2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms