Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RFTN2Q52LD8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms