Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SYTL3Q4VX76 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYTL3Q4VX76 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms