Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms