Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDCD1Q15116 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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PDCD1Q15116 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PDCD1Q15116 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PDCD1Q15116 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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PDCD1Q15116 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDCD1Q15116 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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