Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRS1Q15050 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms