Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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