Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms