Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB39AQ14964 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms