Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMC1AQ14683 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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