Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX3Q13761 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX3Q13761 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms