Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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