Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CUL3Q13618 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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