Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTMR3Q13615 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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