Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms