Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms