Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms