Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms