Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ERVS71-1P61550 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms