Protein–RNA interactions for Protein: P54756

EPHA5, Ephrin type-A receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA5P54756 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA5P54756 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms