Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF6P49848 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF6P49848 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF6P49848 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF6P49848 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF6P49848 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF6P49848 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF6P49848 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF6P49848 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms