Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms