Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms