Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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HOXD3P31249 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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HOXD3P31249 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXD3P31249 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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