Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMBRP28336 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NMBRP28336 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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