Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PEX2P28328 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PEX2P28328 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PEX2P28328 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms