Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms