Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ACTN1P12814 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms