Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DENRO43583 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DENRO43583 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DENRO43583 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms