Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNQ3O43525 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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