Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FABP7O15540 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FABP7O15540 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FABP7O15540 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FABP7O15540 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FABP7O15540 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FABP7O15540 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FABP7O15540 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FABP7O15540 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FABP7O15540 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms