Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM6BO15054 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms