Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF316A6NFI3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF316A6NFI3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms