Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBNO2Q9Y2G9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms