Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms