Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL42Q9P2K6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms