Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPAQ9P0L0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VAPAQ9P0L0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VAPAQ9P0L0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VAPAQ9P0L0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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