Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKIRAS2Q9NYR9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms