Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTPS2Q9NRF8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTPS2Q9NRF8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTPS2Q9NRF8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTPS2Q9NRF8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTPS2Q9NRF8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTPS2Q9NRF8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTPS2Q9NRF8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTPS2Q9NRF8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms