Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms