Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms